• Nel 1973 si è laureato in Storia della Filosofia con punti 110/110 e lode presso l’Università Statale di Milano con una tesi su Filosofia, medicina ed economia nei Fisiocratici, diretta da Mario Dal Pra.
• Dal 1974 al 1990 è stato ricercatore (successivamente primo ricercatore) del C.N.R. presso il Centro sulla filosofia del ‘500 e del ‘600 (Università di Milano), diretto da Mario Dal Pra, poi da Arrigo Pacchi e Enrico Rambaldi; nello stesso periodo è stato membro del Consiglio scientifico del Centro medesimo.
• Dal 1994 al 2004 è stato delegato del Rettore per i rapporti internazionali ed Erasmus.
• E’ membro del Consiglio scientifico di queste riviste: “Giornale Critico della Filosofia Italiana” (Firenze), “Rivista di Storia della Filosofia” (Milano), “Bruniana & Campanelliana” (Roma), “Dianoia” (Bologna), “La Lettre Clandestine” (Sorbonne, Paris). E’ inoltre membro del network scientifico internazionale “La communication manuscrite à l’époque moderne” (CNRS, UMR 5037), del comitato scientifico dell’ “Association Pierre Bayle” (Paris), del comitato direttivo dell’Associazione Italiana degli Storici della Filosofia, del direttivo della sezione italiana dell’Association Internationale de Philosophie de Langue Française. E’ socio corrispondente della International Academy of the History of Science.
  E’ membro dell’editorial board delle seguenti collezioni “International Archives of the History of Ideas” (Springer), “Epicurea” (Schwabe, Basel), “Studi e Testi per la Storia della Tolleranza” (Olschki, Firenze), “Libre Pensée et Littérature Clandestine” (Honoré Champion, Paris).
  Dal 1994 in poi ha sempre diretto l’Unità di Vercelli coinvolta nei Programmi di ricerca di interesse nazionale (PRIN) in storia della filosofia moderna. Dal 2002 al 2005 ha diretto il PRIN nazionale su “Nascita e declino della ragione classica: dal Rinascimento all’Illuminismo” (composto dalle Università: Piemonte Orientale, Roma III, Napoli Federico II, Bari, Calabria, Lecce, Cagliari).
• Dal 2005 (sino al 2007) dirige il PRIN su “Immagini dell’uomo e concezioni della natura: Rinascimento-Età Cartesiana-Illuminismo”, composto dalle Università: Piemonte Orientale, Roma III, Napoli l’Orientale, Urbino, Lecce.
• Dal 2007 dirige il PRIN su: Eredità del Rinascimento e genesi del moderno in filosofia. Edizione di testi e studi sulla storia della filosofia europea da Montaigne al primo Illuminismo, composto dalle Università del Piemonte Orientale, Roma III, Siena, Napoli L’Orientale, Urbino.
• Ha tenuto lezioni, conferenze o è stato “visiting professor” in numerose università, in Italia: Bologna, Calabria, Catania, Firenze, Genova, Istituto di studi sul Rinascimento (Firenze), Lecce (Centro di studi su Descartes), Lessico Intellettuale Europeo (CNR, Roma), Milano (Università Statale), Macerata, Napoli (Istituto di Studi Filosofici), Pisa (Università e Scuola Normale Superiore), Roma “La Sapienza”, Roma III, Salerno, Siena, Torino, Urbino, Verona; e all’estero: Belo Horizonte (UFMG), Cadiz, Chicoutimi (Québec), Dublin, Genève, Halifax, Leiden, London (Warburg Institute), Los Angeles (UCLA and Center for 17th - and 18th-Century Studies), Lugano, Lyon (Ecole Normale Supérieure), Montpellier, Montréal (McGill University), Nancy, New York (RSA), Nijmegen, Paris (Collège de France, Paris I, Paris III, Paris IV, Ecole Pratique des Hautes Etudes, Ecole Normale Supérieure de Saint Cloud, CNRS, IUF, Institut d’Études Avancées), Berlin-Potsdam (Forschungszentrum Europäische Aufklärung), Rio de Janeiro (PUCR), Rotterdam, Rouen, Saint-Etienne, Sevilla, Toulouse, Utrecht, Versailles-Saint Quentin, Wolfenbüttel (Herzog August Bibliothek).
• Ha tenuto corsi di insegnamento all’Ecole Normale Supérieure di Parigi, a quella di Lione e all’Institut d’Études Avancées (Parigi).
• Il suo volume: Skepsis. Le débat des modernes sur le scepticisme (Paris, Vrin, 2008) ha ottenuto il prix La Bruyère 2009 per la letteratura e la filosofia dell’Académie Française.

Il suo principale ambito di ricerca è la storia della filosofia moderna. In particolare, si è interessato della filosofia di Pierre Bayle, a cui ha dedicato un libro (Analisi della fede e critica della ragione nella filosofia di Pierre Bayle, 1980), della cultura filosofica libertina e clandestina tra Seicento e Settecento (si veda l’edizione prima e critica del manoscritto clandestino Theophrastus redivivus, 1981-82 e il volume La philosophie clandestine à l’âge classique, 2005). Ha scritto numerosi saggi su Lipsius, Hobbes, Gassendi, Condillac, Hume, la storia dello scetticicismo e la tradizione dell’empirismo illuministico. Ha curato numerosi volumi collettivi su queste tematiche.

La sua ricerca attuale verte principalmente sulla storia dello scetticismo moderno nel Seicento (su cui ha completato il volume Skepsis, e su cui ha già pubblicato il volume di testi Scepsi moderna, 1991). Sta inoltre lavorando su Hobbes e i suoi rapporti con i contemporanei (specialmente francesi e soprattutto Gassendi), le sue fonti umanistiche e rinascimentali (Valla, Erasmo, Lipsio, il Corpus Hermeticum)

Un altro ambito di interesse è la filosofia francese nella seconda metà del XX secolo e i metodi della storiografia filosofica (temi questi a cui ha dedicato un’ampia sintesi nel volume da lui curato La filosofia della seconda metà del Novecento, 1998).

Libri (come autore): 

• Analisi della fede e critica della ragione nella filosofia di Pierre Bayle (Pubblicazioni del "Centro di studi del pensiero filosofico del '500 e del '600" del CNR - Serie I: Studi, 18), La Nuova Italia, Firenze 1980, pp. x-440.
• Theophrastus redivivus, edizione prima e critica a cura di G. Canziani e G. Paganini (Pubblicazioni del "Centro" cit. - Serie III: Testi, 6), volume I e II, La Nuova Italia Editrice, Firenze 1981-1982, pp. CXXIV-998.
• Scepsi moderna. Interpretazioni dello scetticismo da Charron a Hume, Busento, Cosenza 1991, pp. 528.
• Les Philosophies clandestines à l’âge classique, PUF, Paris 2005, pp. 152
• Introduzione alle filosofie clandestine, Laterza, Roma-Bari 2008, pp. 182
• Skepsis. Le débat des modernes sur le scepticisme. Coll. “De Pétrarque à Descartes”, 78, Paris, Vrin 2008, pp. 448
• Skepsis. Le débat des modernes sur le scepticisme. Montaigne – Le Vayer –Campanella – Hobbes -  Descartes – Bayle,  Coll. “De Pétrarque à Descartes”,  78,
  Paris, Vrin 2008, pp. 448
• Th. Hobbes, Moto, luogo e tempo (De motu, loco et tempore), Italian transl., Introduction and Commentary by Gianni Paganini, “Classici della Filosofia”, Turin, UTET, 2010, pp. 700

Saggi a lunghezza di volume: 

• La filosofia francese della seconda metà del Novecento, in La filosofia della seconda metà del Novecento (Storia della filosofia, già diretta da M. Dal Pra), vol. XI, seconda edizione interamente riscritta e ampliata, a cura di Gianni Paganini, Piccin/Vallardi, Padova 1998, t. I pp. 185-438 e appendici bibliografiche pp. 713-756
• Hobbes, Gassendi und die Hypothese der Weltvernichtung, in Konstellationsforschung, hrsg. von Martin Mulsow und Marcelo Stamm, Suhrkamp, Frankfurt a. M. 2004, pp. 258-339
• Haupttendenzen der clandestinen Philosophie, in Ueberwegs Grundriss der Geschichte der Philosophie, Die Philosophie des 17. Jahrhunderts, Band 1/1. Hrsg. v. Jean-Pierre Schobinger. Teil 1 Allgemeine Themen, Schwabe, Basel 1998, pp. 121-195

Volumi (come curatore): 

• Materia actuosa. Antiquité, Age classique, Lumières. Mélanges en l’honneur d’Olivier Bloch, recueillis par M. Benitez, A. McKenna, G. Paganini et J. Salem, Champion, Paris 2000, pp. 748
• La filosofia del Novecento e la sua storia. Questioni di metodo e prospettive di ricerca, Atti del Convegno di Vercelli, 31 maggio – 1 giugno 1999, a cura di Gianni Paganini, in “Rivista di Storia della Filosofia”, a. LVI (2001), pp. 181-305
• Scepticisme, Clandestinité et Libre Pensée / Scepticism, Clandestinity and Free-Thinking, Actes des tables rondes organisées à Dublin dans le cadre du Congrès des Lumières (Tenth International Congress on the Enlightenment), sous la dir. de Gianni Paganini, Miguel Benitez et James Dybikowski, Champion, Paris 2002, pp. 382
• The Return of Scepticism. From Hobbes and Descartes to Bayle. Proceedings of the Vercelli Conference, May 18th-20th, 2000, ed. by Gianni Paganini, “International Archives of the History of Ideas”, 184, Kluwer, Dordrecht-Boston-London 2003, pp. xix-486
• Der Garten und die Moderne. Epikureische Moral und Politik vom Humanismus bis zur Aufklärung. Arbeitsgrespräch der Herzog August Bibliothek, Wolfenbüttel, 23. und 24 November 2000, hrsg. von Gianni Paganini und Edoardo Tortarolo, Frommann - Holzboog, Stuttgart 2003.
• Pluralismo e religione civile. Una prospettiva storica e filosofica, Atti del Convegno di Vercelli, a cura di G. Paganini e E. Tortarolo, Milano, Bruno Mondadori, 2003
• Pierre Bayle dans la République des Lettres. Philosophie, religion, critique, éds. A. McKenna et G. Paganini, Champion, Paris 2004
• Renaissance Scepticisms, ed. by G. Paganini and J. Maia Neto, Proceedings of the conference held at the RSA meeting in New York, “International Archives of thi History of Ideas”, Springer, Dordrecht-New York, 2008
• Illuminismo. Un vademecum, a cura di G. Paganini e E. Tortarolo, Bollati Boringhieri, Torino 2008
• Skepticism in the Modern Age. Building on the Work of Richard Popkin, ed. by J. R. Maia Neto, G. Paganini and J. Ch. Laursen, Brill, Leiden-Boston, 2009
• Le origini dell’umanesimo scientifico. Dal Rinascimento all’Illuminismo, a cura di L. Bianchi e G. Paganini, Napoli, Liguori, 2010
• Le scepticisme des Lumières, éd. par G. Paganini et S. Charles, Saint-Etienne, Publications de l’Université de Saint-Etienne (sous presse)

Facoltà di Lettere e Filosofia Univ. degli Studi del Piemonte Orientale

• Storia della Filosofia